就在清军入关之前的几个月，人称雄才大略的皇太极去世，皇太极长子豪格和睿亲王多尔衮两方的矛盾升级，最终决定，年仅六岁的爱新觉罗·福临出人意料地登上皇位，顺利的成为清朝第三位皇帝，此人就是顺治帝。起初顺治选择储君的时候，只有福全和玄烨两人，顺治经过反复的掂量，最后选择了玄烨，却没有选福全，这里面总结下来主要有两点原因。
第一点是顺治的母亲孝庄太后支持玄烨，第二点是康熙得过天花，生命力顽强。在清朝这一历史阶段，公元1661年，年仅24岁的顺治皇帝去世。顺治皇帝——爱新觉罗·福临6岁即位，是清朝入关后的第一位皇帝。对于中国古代历史上的封建王朝，在皇位继承上基本遵循嫡长子继承制的惯例，也即立嫡以长不以贤。
由于福全是宁悫妃董鄂氏（不是顺治最爱的董鄂妃）所生，生母身份卑微，而且孝庄从一开始就讨厌董鄂氏，这也间接导致了孝庄不喜欢福全，而玄烨从小就深受孝庄的喜爱。
更为重要的一个因素是，顺治的死，正是中国历史上的一个天花肆虐期，对清王朝的统治带来很大的影响。清朝没有遵循嫡长子继承制，并不表示玄烨就一定可以继承皇位。
据史料记载，顺治皇帝共有6个儿子，因为长子早夭，所以实际上为5个儿子。在这5个儿子中，康熙仅仅排行第三，他还有一个哥哥和四个弟弟。因为清朝没有遵循嫡长子继承制，所以顺治皇帝的这5个儿子都有可能继承皇位。顺治皇帝最喜欢的皇子却不是玄烨，而是排行第二的福全，福全是董鄂妃的儿子。
顺治皇帝最宠爱董鄂妃，因为爱屋及乌，所以自然也非常喜欢福全这个儿子。对于顺治皇帝来说，本来是希望将皇位传给次子福全。
玄烨表现出色，福全无心皇位。玄烨幼年的时候聪慧过人、勤奋好学，长得更是天姿英俊，所以，在几位皇子中格外出众。玄烨6岁的时候，和哥哥弟弟们一同去给父皇请安。
顺治帝就一一询问众皇子的意向，次子福全说他愿意做一代贤王，剩余的的皇子就开始是唯唯诺诺，不敢多说话。为了政权的能够稳住，最终，顺治帝在临终之前，说白了皇位的继承人为三子玄烨。很多种的作用之下，才有了后来的被称为\"千古一帝\"的康熙皇帝。